Jocelyne FanonLa shigellose inquiète les autorités sanitaires françaises. Cette infection intestinale, causée par la bactérie Shigella, progresse en France depuis plusieurs années et une nouvelle menace s'y ajoute : l'apparition de souches hautement résistantes aux antibiotiques, documentée par l'Institut Pasteur dès 2022 et confirmée en 2023 avec 1 595 souches identifiées par le Centre national de référence (CNR). En ce début d'été 2026, avec la hausse des rassemblements, des voyages et des conditions favorables à la transmission fécale-orale, il est indispensable de savoir reconnaître les signes d'une shigellose et de comprendre quand consulter un médecin en urgence.
Qu'est-ce que la shigellose ?
La shigellose est une infection gastro-intestinale aiguë causée par des bactéries du genre Shigella. Elle se transmet principalement par voie fécale-orale : contact direct avec une personne infectée, consommation d'eau ou d'aliments contaminés, ou contact avec des surfaces souillées. Elle est extrêmement contagieuse — quelques dizaines de bactéries suffisent pour déclencher la maladie, contrairement à d'autres germes intestinaux qui nécessitent des milliers d'unités infectieuses.
En France, deux espèces dominent : Shigella sonnei, la plus fréquente dans les pays industrialisés, et Shigella flexneri, plus répandue dans les zones à faible niveau d'hygiène. Ces deux espèces circulent dans des contextes différents : collectivités de jeunes enfants (crèches, écoles primaires), communautés religieuses résidentielles, et plus récemment dans la communauté des hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (HSH), qui représente un vecteur de transmission croissant en Europe.
Symptômes : ce qu'il faut surveiller
L'incubation est courte : les premiers symptômes apparaissent généralement 24 à 72 heures après l'exposition à la bactérie. Les signes classiques d'une shigellose sont les suivants :
Diarrhées abondantes, souvent sanglantes. C'est le signe cardinal. Les selles peuvent contenir du sang, du mucus ou du pus, signe que la bactérie a colonisé la muqueuse intestinale et provoque une inflammation locale intense.
Crampes abdominales sévères. Les douleurs sont souvent localisées dans le bas-ventre et peuvent être continues ou paroxystiques, s'intensifiant avant chaque épisode de diarrhée.
Fièvre. Une élévation de la température est habituelle, parfois supérieure à 39 °C, particulièrement chez les enfants.
Nausées et vomissements. Fréquents en début de maladie, ils accentuent le risque de déshydratation.
Ténesme rectal. Ce besoin intense, douloureux et répété d'aller aux toilettes, sans évacuation efficace, est caractéristique des infections à Shigella. Il témoigne de l'irritation rectale par la bactérie.
Chez l'adulte en bonne santé, la maladie évolue généralement vers la guérison spontanée en 5 à 7 jours. Mais certains patients développent des complications qui nécessitent une prise en charge médicale rapide.
Quand consulter un médecin en urgence ?
Plusieurs situations imposent de ne pas attendre et de contacter un médecin ou de se rendre aux urgences :
Diarrhées sanglantes persistantes au-delà de 48 heures. La présence de sang dans les selles signale une atteinte muqueuse importante ; si elle ne régresse pas rapidement, un traitement médical est indiqué.
Déshydratation sévère. Les signes d'alarme sont : une soif intense, des urines foncées (ou absence d'urines), une sécheresse buccale, des vertiges en position debout, une confusion ou une faiblesse extrême. Chez le nourrisson et le jeune enfant, la déshydratation peut être rapidement dangereuse.
Fièvre supérieure à 39,5 °C ne cédant pas aux antipyrétiques. Un tableau fébrile intense, notamment associé à des frissons, peut indiquer une bactériémie (passage de la bactérie dans le sang), une complication rare mais grave.
Persistance des symptômes au-delà de 7 jours. Une shigellose qui dure indique soit une souche particulièrement virulente, soit une complication (colite hémorragique, syndrome hémolytique et urémique chez l'enfant), soit une résistance aux mécanismes de défense de l'organisme.
Contexte de voyage récent dans une zone endémique. Les shigellosess contractées à l'étranger peuvent être causées par des souches plus agressives ou plus résistantes aux antibiotiques habituellement utilisés en France.
⚕️ Avertissement YMYL : cet article présente des informations générales à visée éducative et ne se substitue pas à une consultation médicale. En cas de doute sur vos symptômes, consultez un médecin.
L'enjeu alarmant de la résistance aux antibiotiques
La shigellose se traitait traditionnellement avec des antibiotiques comme la ciprofloxacine ou l'azithromycine. Mais l'Institut Pasteur a documenté l'émergence en France de souches XDR (extensively drug-resistant) : ces souches sont résistantes à la fois à la ciprofloxacine, à l'azithromycine et aux céphalosporines de troisième génération. Selon les données du CNR, la proportion de souches XDR atteignait déjà 21,7 % des cas détectés à fin août 2022.
Les seuls antibiotiques encore efficaces contre ces souches résistantes sont les carbapenèmes et la colistine — des traitements de dernier recours, habituellement réservés aux infections hospitalières graves. En pratique, cela signifie qu'une part croissante de patients atteints de shigellose ne peut plus être traitée en ambulatoire avec des antibiotiques standards. L'automédication antibiotique, en plus d'être inefficace, aggrave cette résistance.
Cette situation explique pourquoi il est crucial de consulter un médecin dès que les symptômes sont importants ou persistants : seul un professionnel de santé peut évaluer le tableau clinique, décider si un traitement antibiotique est justifié, et choisir la molécule adaptée après avoir documenté la résistance, si nécessaire via une coproculture.
Prévention : les gestes essentiels
La prévention reste le premier rempart contre la shigellose, d'autant plus que les traitements deviennent plus complexes :
- Lavage des mains systématique avec du savon après être allé aux toilettes, avant de préparer ou consommer des aliments.
- Hygiène alimentaire : éviter les crudités et les fruits non pelés dans les pays à risque, ne consommer que de l'eau embouteillée ou traitée lors de voyages.
- Isolement des personnes infectées des collectivités (crèches, écoles) jusqu'à la guérison complète et confirmation de deux prélèvements négatifs, selon les recommandations de Santé Publique France.
- Prudence dans les relations sexuelles impliquant un contact oro-fécal, avec l'utilisation de barrières adaptées.
Si vous avez récemment été en contact avec une personne atteinte de shigellose, ou si vous présentez des symptômes digestifs après un séjour à l'étranger, un médecin généraliste ou un spécialiste en maladies infectieuses peut vous orienter rapidement vers les examens appropriés et un traitement adapté.
Faire appel à un expert de santé
Face à des symptômes digestifs persistants ou inquiétants, l'avis d'un médecin reste indispensable. Sur Expert Zoom, des professionnels de santé sont disponibles pour une première consultation rapide, en téléconsultation ou en cabinet. Pour les cas d'intoxication alimentaire ou d'infection digestive, un diagnostic précoce évite les complications et permet d'adapter le traitement aux résistances actuelles.
Retrouvez également notre article sur les signes d'intoxication alimentaire à surveiller après un restaurant et les alertes liées au rappel de viandes hachées contaminées par E. coli en France.
Pour les données épidémiologiques officielles sur la shigellose en France, consultez la fiche maladie de l'Institut Pasteur.
